代谢组学技术在中药研究中的应用主要体现在以下几个方面：
1. 中药成分分析与质量控制
部位鉴别：消化吸收率组学技艺设备也能对药村中的无机化学反应部位确定局面定性分析，鉴别出药村中的活性酶类酶部位。列举，通过由于质谱（MS）的消化吸收率组学技艺设备，也能够 鉴别出冬虫夏草中的冬虫夏草皂苷等活性酶类酶部位。种技艺设备还也能够 鉴别入药和非入药部位的无机化学反应图标物，为药村的质量水平有效控制给予根据。
产品品质的保持：能够新陈消化吸收组学技术工艺，需要对草药方方的产品品质做出分析一下和的保持。举例子，使用树种新陈消化吸收组学分析一下，需要搭建共性类风湿病性膝盖炎的草药方方因素的产品品质箭头的参考值方式 。凡此种种，新陈消化吸收组学还需要判断草药方方中的渗透性因素简答渗透性原则，如能够UPLC-Q-TOF-MS科研，差别有所不同乌头树种的化学反应因素，并判断享有镇疼活性酶和亚急性渗透性的海洋生物碱。
2. 中药药效机制研究
能力靶点辨别的：产生组学新技术就可以帮到辨别的中药配方几丁质酶组成的大分子靶点。如，探析察觉雷公藤红素可经过调高Treg/TH1和Treg/Th17均衡、阻挡NF-κB环路等逻辑利用免疫抑制能力。
效应机理阐明：新陈分泌组学方法能够体现了中药方茶缓解急病的效应机理。举个例子，探析遇到青蒿素抗药与疟原虫的线粒体新陈分泌该变有关的，非靶向疗法新陈分泌组学体现了了与该时涉及到的的新陈分泌物发展。还有，新陈分泌组学还就能够确认进行分析新陈分泌物的发展，探析中药方茶复方的效应机理。
3. 中药安全性评价
致癌性工作制度理论研究定性分析：分解组学技木是可以中用理论研究定性分析中葯的致癌性工作制度。列举，可以通过分解组学和16S rDNA测序的组合定性分析，呈现了清益汤对危重症慢性胰腺炎相应的慢性肺磨损的保证工作制度，并判定了铁沉着冷静、地域差异分解物和益生菌制品菌群之前的原因。
稳定可靠性分析：基础代谢组学技术水平还行利用于中药茶方的稳定可靠性分析，辨别因素的渗透性成份和渗透性靶点，因此为中药茶方的稳定可靠利用给出完美依照。
4. 中医证候研究
证候涉及到消化吸收物了解：消化吸收组学科技会中用科研方法与中国传统医学妇科证候涉及到的内源性消化吸收物发生变化，助手中国传统医学妇科证候的鉴别诊断和调控。比如说，根据消化吸收组学科研，已在冠相思病客户中技术鉴定出与痰瘀证随和阴两虚证涉及到的海洋生物标记物。
证候矫治数据分析：排泄组学技巧设备还能主要符合数据分析中药才对中医药证候的矫治作用。譬如，经由排泄组学技巧设备及聚类算法数据分析法，遇到“黄芪-茯苓-泽泻”等联系中药选择装配适主要符合肾病全方位的征的新组方中药，能够对各种肾病全方位的征有关的菌物标志logo物诞生会影响。
5. 多组学技术整合应用
两组学资源构建：消化吸收组学与相关组学枝术（如染色体组学、转录组学、核蛋白组学等）的资源构建选用，为中草药配方的研究保证一个多样化空间的阐述层次结构。此种资源构建选用这样不仅加剧了人们对中草药配方化学成分在原子层面所进行上对人体健康生理学和病检心态的直接影响，并且为阐明中草药配方的意义管理机制和效果元素地基保证了强坚实的方法。
病症开展规则：两组学技巧都可以用在科学研究西药开展病症的原子规则。举例说明，确认蛋清酶质组学和基础新陈代谢组学的联手应用软件，阐明了与中医针灸各类的膝肘关节软骨骨性肘关节软骨炎密不可分相关内容的差别的表达出来蛋清酶和基础新陈代谢信号通路。
分泌组学技能在中西药钻研中的应用软件，为中西药的新新型工业化和准确整形供应了比较重要的科学合理的支持，能有效的带动中西药的规格化和香港现代化不断发展。