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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

不停用于纸业生物学原料而被耳熟能详的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分泌废物回收”拥有“藏宝小团伙”的坚辛过程相似性,直至近二十一两年才被发现了其主要的怪物学系统,再也“起身农奴把唱歌”,非常是在免疫抗体皮肤发病性皮肤发病探索领域行业内与时共进。已经存在多页文献资料熟知 了在各种类型皮肤发病性皮肤发病的食草动物模板中享受衣康酸或其生物学遮盖衍怪物的控制益处,连接数现了其因素靶点。有关衣康酸的“前世姻缘”与“今世”,具体情况见文章《乳酸的逆转兄弟姐妹——衣康酸!这课让你熟知 衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸修饰语淀粉酶组学产品,实现1000+深奥度装饰位点检测出,安全逆转典型靶点,全地方生信浅析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“看见”到“手机验证”全流程步骤服务培训,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、工作过程

02、监测大数据

03、经“点”再次出现

在评测数值中,查出诸多学术论文中消息的经典爱情靶点举例说明衣康酸绘制语位点,如首先个被察觉的衣康酸共价绘制语蛋清KEAP1,还在糖酵解环路中的3个重要性酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,还有炎性小体分为蛋清NLRP3和组织病变时候中的重要性蛋清RIPK3等,其质谱图下面的图如图。

04、货品优势特点

1.几吨质控

业务化炎症因子朋友探头孵育、SDS-PAGE检查测量、WB效验、样例相应的性解析等多方面位检查测量,确保创业项目结杲能信性。

2.高机械性能质谱实验仪器系统

在Orbitrap Astral全新第一代高分别质谱仪火供下,确保衣康硝化作用体现位点及蛋白酶鉴定费新深入,助力器科学调查调查新发掘。

3.全步骤一趟式贴心服务

体系结构拜谱生物制品改善的实验性网站,可出示“细胞系养育→测试探针孵育→WB监测→深奥度衣康碱化呈现监测→专有生信定性分析→某一位点PRM证实”全步骤精准服务,省时省事更又省心。

05、研究文章(有些)

06、操作导向

PART 2、学术论文推荐

文献综述一

英语翻译大标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名标题格式:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

深入分析的内容:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

论文参考文献二

英文翻译标题文字:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

英文版子标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研发网站内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、典型案例诞生方法

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13有很强的底物运用能力素质,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物制品衣康酸性反应淡化组亲测的数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用装饰(有以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结ppt

用作TCA不断循环中的之間新陈细胞分解物,衣康酸调试新陈细胞分解、免疫抗体性细胞和发炎之間的之间使用,为中药治愈免疫抗体性细胞发炎性皮肤病症具备了代用中药治愈手段。衣康酸设备构造中的亲电性α,β-不呈现饱和状态羧酸设备构造能对蛋清质上的活力半胱氨酸残基实行烷基化呈现(迈克尔增益反馈),这些翻意后呈现被称做“衣康酸呈现(itaconation)”,转而影响到蛋清质特点,改善免疫抗体性细胞回话和新陈细胞分解行业,为好几种皮肤病症性药物生产制造具备新设想。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸体现核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物生物学一定降钙素原检测靶向治疗排泄组(QMT1000)或激光能量排泄靶向药物排泄组新产品对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

选取毕业论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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