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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 微信网络临床药理学体现草酸钙肾结石阳极氧化应激反应和宫颈炎症损害机理

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿设计最经种类的急病之中。肾组织安排中CaOx纳米线过趋于稳定沉淀积累会引致肾小管神经元问题和凋亡,故而引致肾结石的养成。短链人体脂肪含量酸由直肠内活性污泥法日常细菌食物发酵饮食玻纤导致,不光在轮廓线直肠防御系统性中挥发效用,特别在设计横向上也挥发重要效用。进来,丁酸是最丰富多彩的短链人体脂肪含量酸,拥有天然免疫调节和天然免疫调节效用,本实验研究综述丁酸对CaOx肾结石的效用以及其不确定靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山三甲医院泌尿普外吴忠讲解、周子健搏士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教援、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱海洋生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网络数据药剂学学产品,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

优秀文章分类:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 客企业单位:华山医阮 科研群体:大鼠、HK-2血细胞 分成小组信心:差表组(Con)、类别组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱给出新技术:网药学学判断

思绪标准流程表

探索最终结果

探究相关人员第一个创设大鼠沙盘模特,经过人体生理什么是生化完成指标和组织开展病检学着色等探究具体方法察觉丁酸可不可以减小CaOx沙盘模特大鼠肾CaOx结晶的确立和神经磨损,提高CaOx沙盘模特大鼠的支原体感染神经磨损和防氧化反应有害物质的过量理解。另外,丁酸还抑制性草酸介导的HK-2神经上皮细胞神经磨损、防氧化反应应激反应和神经上皮细胞凋亡。 为学习性丁酸组成和靶表观遗传组无线网,学习相应人员从PubChem了解丁酸和丁酸酯的二维和3D组成(图1A)。经过PharmMapper信息库和Uniprot信息库加工处理后共需求出11八个丁酸靶表观遗传组供进十步剖析。将表观遗传组表单把手机通讯录STRING信息库,实现PPI无线网剖析。Cytoscape给定了筛选的前20的交通核心区靶表观遗传组的完整无线网图,分为CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这样的交通核心区表观遗传组与无线网中的其他表观遗传组均现象出某种的相应性,原因探讨这样的表观遗传组能够会挥发着协同作战角色。GO和KEGG剖析证明了丁酸交通核心区表观遗传组的相应方式和微生态学功能模块(图1C)。交通核心区表观遗传组包括与类固醇刺雄激素初次初次应答、硫化应激性性初次初次应答、灵化学活化氧神经细胞对类固醇刺雄激素敏感的体现以其对酸碱性催化杂质的体现相关联。笔者认为所写,这样的交通核心区表观遗传组包括参加了硫化应激性性和对灵化学活化氧的微海洋生物体现全过程,是肾结石产生措施中至关重点的方式,这意味着丁酸能够会在肾结石中挥发重点角色。

图1| 丁酸构成与靶人类基因网咯概述(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进的一步生命的进化丁酸对CaOx肾结石真的切靶什么是染色体,理论科学设计考生巧用GEO信息库对GSE73680中正常對照与CaOx肾结石求美者的什么是染色体区别对其实现了理论科学设计。對照组与CaOx结石求美者的正相关联内容的性区别表答什么是染色体(DEGs)塞查规格为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个什么是染色体引发正相关联内容的波动,在这其中3379个(89.4%)什么是染色体表答上涨,404个(10.6%)什么是染色体表答下降(图2A)。对DEGs对其实现聚类算法算法剖析,热图表现了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类算法算法功能(图2B)。然后,理论科学设计考生借助GeneCards信息库人工工资监定了370个有机会与CaOx肾结石相关联内容的的什么是染色体,的排名前20位的分析什么是染色体下列关于相关联内容的性打分长为2C如图。成了发现丁酸治疗方法CaOx肾结石的关健靶点,理论科学设计考生将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相关联内容的什么是染色体外理得见一堆个Venn图。进而,CYP2C9被敲定为丁酸后果CaOx肾结石的暗藏靶点(图2D)。前者,理论科学设计考生还对其实现了丁酸与CYP2C9的团伙挂接,CYP2C9的八个胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸相互间用途,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在根据互联网药理学学預測CYP2C9是丁酸损害CaOx肾结石的靶dna后,论述者还能够生殖癌细胞研究确认了CYP2C9可减小草酸诱导型的HK-2生殖癌细胞的ROS总体水平、感染受损和凋亡。

图2| 往往据库联手研究予测CYP2C9是丁酸功效于CaOx肾结石的靶什么是基因

研发后果

本实验性1会出现 丁酸在休内和休内均能控制CaOx肾结石实体模型的空气脱色应激状态状态和支原体感染神经受损,紧接着完成电脑网络上药学学挑选赢得丁酸作用CaOx肾结石的暗藏靶点——CYP2C9,之后完成体内部实验性声明CYP2C9在草酸盐诱导性的HK-2体内部ROS水平方向、支原体感染神经受损和凋亡。这会出现 意味着丁酸将会完成控制CYP2C9来控制CaOx肾结石的空气脱色应激状态状态,减弱支原体感染神经受损。某一期间中拜谱生物体体能提供了电脑网络上药学学科技的服务培训,与此同时拜谱生物体体可上升发育成熟进一步优化的什么是基因组学、蛋清质组学、分解组学等多个学的产品及科技的服务培训,欢迎大家垂询资询! 考虑资料:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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