
近日,东莞医科学校时一号附加医疗王学浩院土项目团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶向治疗电能分泌检测分析服务。
日文名称:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文版题头:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
朋友企事业单位:南京医科大学
论述资料:细胞
拜谱提供了服务于:转录组测序+球蛋白互作组+靶向疗法正能量排泄组
的技术途径:
深入分析报告单
01、YBX1被监定为HCC中糖酵解的重中之重基因组
本探讨采集器HCC肿癌模板(n=7)的单神经元RNA测序数剧定性研究集做定性研究,出现糖酵解几丁质酶重要集中式在肿癌神经元中,hdWGCNA定性研究识別出9个dna控制模块(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的孤岛经营定性研究确定好YBX1为独立的孤岛经营安全风险原因(图1H)。深入一个脚印紧密联系IHC、WB科学实验和肿癌阻止与周围非肿癌阻止的环境转录组学数剧定性研究集证明YBX1是肝神经元癌医治的潜在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被确保为自动调节HCC受损细胞糖酵解的最为关键的影响
02、YBX1使得HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向药物能力排泄组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和分裂繁殖
03、OGT与YBX1运用并有利于促进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合在一起并加快YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增强学习其磷酸性反应,因此力促其核转位
进的一大步检测工具YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是的影响其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC血受损细胞中或用OGT抑制性剂OSMI-1正确整理,YBX1血清酶横向不错大大限制,YBX1磷酸性反应不错限制(图4A-C)。IP科学实验是正因为,在一样的的Flag-YBX1底物横向下,YBX1-WT的磷酸性反应横向不错高与YBX1-T57A,是正因为磷酸性反应的延长不光仅是正因为更快的YBX1血清酶传达(图4D)。提取了核和质类物质显示TMG正确整理的HCC血受损细胞中YBX1核传达的提升(图4E-F),进的一大步显示YBX1磷酸性反应的重点调分子是AKT(图4G-I)。这显示透露O-GlcNAc糖基化用利于其磷酸性反应来提高YBX1血清酶稳定的性并利于核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 装饰有助于于其加大力度一个脚印有磷过酸装饰并就可以使得其核转位
05、YBX1增进PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1增进PKM2转录
06、YBX1 可能加快组血清乳碱化掩盖程度
探索会发现YBX1敲低取得大幅度拉低淀粉酶质乳过酸,特别是是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解抑止剂2-DG的实验所可确认了糖酵解与组淀粉酶乳过酸的一直绑定qq,抑止糖酵解可取得大幅度拉低H3K18la技术(图6D)。PKM2过展示可逆反应转YBX1敲低引起的H3K18la回落,以外源乳酸治理不只是加快H3K18la,还伴有YBX1展示上涨,表示具备正在向反应(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR可确认,H3K18la顺利通过聚集于YBX1重新启动子一直加速其转录,该的过程受O-GlcNAc糖基化监测(图6H-J),并会发现P300 上涨是YBX1资料H3K18乳酰凝成用的机制化(图6K-L)。
图6.YBX1改善H3K18乳过酸表达水平面
内容总结ppt
在这些调查中简讯了YBX1在HCC中高表示,然后与糖酵破译切相应的。YBX1在T57处被O-GlcNAc体现,所以促进高血清质并加剧其表示。这般体现还有利于加快YBX1在T57处的磷碱化,有利于加快其核易位。故而,这一个进程促进了糖酵解相应的染色体的转录并多种多样乳酸的产生了。还有就是,YBX1激活卡P300的转录,必将win7驱动组高血清的乳碱化,专门是H3K18la,H3K18乳碱化朝管控YBX1染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观基因遗传正反面馈环规则图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物学为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶点能力产生组技术服务,拜谱生物制品建立了完善成熟的转录组学、核蛋白组学、全文翻译后装饰组学、基础代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
关联性论文文献综述
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.