在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

探讨結果

1、从光敏塑造培养上皮细胞中生成DNA化学交联球胆固醇

为了能分离法光化学热塑球胆固醇-DNA黏结物用来LC-MS浅析，作家发展半个种转化纯化方式，可从DNA中去如果不是化学热塑球胆固醇，仅在照光时根据直接的染色的体组触及生物富集DNA化学热塑球胆固醇。用TRIZOL转化成染色的质并除去落网获的非化学热塑球高血清酶，第二将其完后溶解完以展开RNase吸收系统。根据超声检查拷贝得到球胆固醇化学热塑DNA的转化成物，在硫氰酸胍中烧开转化，并在二空气氧化硅离心法柱上晕厥洗衣机清洗以去如果不是化学热塑球胆固醇必定会进行。根据核酸酶处理从DNA中降低光化学热塑球高血清酶，并展开胰球高血清酶酶吸收系统用来LC-MS浅析。该形式创建为球胆固醇化学热塑DNA转化成或XDNAX。

图1.蛋清质热塑DNA取出或XDNAX的过程流程图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可间接接受DNA的核胆固醇图谱

将光化学交联的方法技术应用于MCF7神经元，察觉到了1,805种得票数血清质，进来1,191种具有于3个或大量次再次中。60%的DNA互不反应组有带核酸紧密结合实际的GO引用，在贫乏核酸紧密结合实际引用的血清质质中，最大程度的奉献位于核纤层血清质，而后是参与到复染质组织化和神经元瓦解的血清质质（图2）。

图2 . 可随便触碰 DNA 的蛋白酶质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3总结结尾了DNA主动帮助组所蕴涵的蛋清质-DNA表面和其含有的核苷酸化学交联肽。这涉及到随着（1）球状DNA紧密联系空间结构域、（2）DNA 紧密联系起居不规律区（IDR）和（3）随着与各种蛋清质（列举组蛋清紧密联系蛋清）、RNA（列举剪接分子）或相分离法区室（列举核仁蛋清）主动帮助而导至的生态类似。

图3 . 可进行玩 DNA的设计域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、化学发光法细胞系扰动期間与DNA搭配的转录成分

雌荷尔蒙蛋清激酶α（ESR1）驻在胞质溶胶中，有一天撞见其配体，释放易位到内部系核，在在那里它与基因遗传组中的既定地域运用以解锁既定的转录系统。将血清饥饿的MCF7内部系外露于高含量雌荷尔蒙（10 nM 17β-雌二醇）4430分钟，与模拟系统外理的差表内部系十分二者的DNA互不反应组（图4A）。中仅，雌荷尔蒙促进后DNA互不反应组中的ESR1提升了30倍（图4B）。总的来看，在1,814个按量的蛋清质-DNA互不反应中，约有9%彰显出已经超过2倍的不错变化规律，并观察植物到与ESR1兼有互不反应的蛋清如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌肾上腺素工作乳腺癌癌肿瘤细胞 DNA 彼此之间用组的按量是比较（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

个人心得体会

科研分析做出dna组的营养物质质以模糊不清它是该如何被读取数据并付诸实践教学的，时不时是成果转化成员是一个长时的追随。dna组可及性最主要以DNA为中间的方向做出科研分析，其实，到到目前说不定说不定，印染质凝胶的意义中的什么营养物质质与DNA 再次发生物理性之间意义尚不模糊不清。选择零间隔光热塑，可出现 DNA之间意义组中的一般数营养物质质，XDNAX能力将当作营养物质质-DNA之间意义科研分析的强劲辅助工具。

拜谱总结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的血清质组学、装饰组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

关联性论文资料：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.