
2024年9月由沈阳林业读书张万刚讲师人员在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱怪物为该研究提供了亚硝基化体现组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名字题头:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2023年引响指数公式:5.7
刊发时长:2024年9月
客服院校:南京农业大学
论述用料:蛋白
拜谱可以提供方法:亚硝基化修饰组学
方法线路:
一、探析然而
01.Caspase-3特异性
现下尚不清晰NO对caspase-3的压加工制效应需不需要归因于NO介导的S-亚硝基化,与众不同溶液浓度均值的GSNO成为外源性NO制造,以促进caspase-3的休外S-亚硝基化。效果是因为,与没GSNO的组相较,100、200和400μM GSNO组的caspase-3化学活化强势缩减(图1),与原先通讯稿不符。GSNO净化处理缩减caspase-3化学活化的潜在性根本原因仍亟需相一致。
图1 区别氨水浓度的GSNO治疗对caspase-3可溶性的引响
02.Caspase-3的S-亚硝基化层面
学习Caspase-3的亚硝基化成度,以阐释GSNO对Caspase-3的影响性。经GSNO净化处理后,测量到caspase-3淀粉酶S-亚硝基化抗拉强度上升(图2)。许多报告单反映出,外源性GSNO的培养可出色引诱caspase-3的身体之外S-亚硝基化。惹人惊叹的是,在不会有GSNO留存的差表组中测量到是一个暗淡的S-亚硝基化带,这反映出caspase-3能够突发内源性的S-亚硝基化。除此以外,本学习中caspase-3的S-亚硝基化成度较高,而caspase-3的生物调低,这与已经的学习完全一致。其实,caspase-3的特男人S-亚硝基化掩盖位点尚不清理,还必须 进一次的探索性。
图2 GSNO工作对caspase-3S-亚硝基化能力的不良影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化突显组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。紫色标上符号的字段表现S-亚硝基化肽,紫色标上符号的C表现S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3挥发结球蛋白
结淀粉酶作为一个其中一种根本的神经内部骨架淀粉酶,在保持肌神经内部空间结构设计的空间结构设计系统性和弯曲性等方面起着根本作用,探析S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶生物分解的敏主观性有着着根本作用。与Std(未用胱天淀粉酶酶-3和GSNO孵育的初始状态肌仟维淀粉酶)组不同之处,0 μM GSNO组(肌原仟维和caspase-3的孵育,无GSNO)的系统结淀粉酶量不错减轻,显示系统caspase-3对结淀粉酶有着着存在的淀粉酶溶解功能。在GSNO孵育后,系统结淀粉酶的量很大增大(P < 0.05)。还有就是,当GSNO渗透压变高时,系统结淀粉酶的量坚持调涨(P < 0.05)(图5)。此出现 证实,SNO淡化的caspase-3以水准依赖感的方案可抑制结淀粉酶的生物分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3挥发结核蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3可降解肌钙蛋白酶-T
肌钙球淀粉酶酶酶质-T (TnT)是原肌球球淀粉酶酶酶质调高提供肌缩水的丝条的都要肌原弹性植物化学纤维球淀粉酶酶酶质。TnT的溶解的特点是测试到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化状态下,caspase-3对TnT的溶解条件右图6右图,与Std组(不包含caspase-3和GSNO的肌原弹性植物化学纤维)比起,caspase-3组中30 kDa TnT段落凸显上升,阐明caspase-3体验了TnT的溶解,除外,caspase-3与GSNO的孵育致使30 kDa TnT走低。在100和200 μM GSNO组之前没了测试到凸显的区别(P > 0.05),而当GSNO的酸度到400 μM 时,该段落凸显不良影响力(P < 0.05)。这个知道阐明了SNO绘制的caspase-3对TnT溶解的抑制性的功效。结球淀粉酶酶酶质和TnT是caspase-3的敏感度底物,而GSNO治疗不良影响力caspase-3的活力已经致使肌原弹性植物化学纤维球淀粉酶酶酶质溶解限度不良影响力。上述上述,NO诱发的S-亚硝基化可使用绘制半胱氨酸残基来调高caspase-3的活力,转而进1步不良影响力其对结球淀粉酶酶酶质和TnT的球淀粉酶酶酶质油脂水解功能,导致不良影响力羊肉好品质。
图6. S-亚硝基化caspase- 3化学降解肌钙血清-T
二、工作小结
本研究方案我委一起探讨S-亚硝基化对caspase-3绘制的不良不良影响和其马上又对牛羊肉肌原人造合成纤维身体外化学降解的不良不良影响。蛋清S-亚硝基化能绘制caspase-3的半胱氨酸残基,而使造成的caspase-3活性酶类减低,进一次调节了其对牛羊肉肌原人造合成纤维蛋清的蛋清电离水平。三、拜谱个人总结
研究方案适用了酶活法测定,亚硝基化绘制组学研究方案,WB等查测伎俩,看到球淀粉酶S-亚硝基化可以绘制caspase-3的半胱氨酸残基,这引致了caspase-3活性酶类的减轻,齐头并进第一步抑止了其对鸡肉肌原仟维球淀粉酶的球淀粉酶球蛋白质含量水解效果。本研究方案为表示球淀粉酶质亚硝基化对口感的改善制度带来了好几个个新的的视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球胆固醇组学、表达球胆固醇组学、消化吸收组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系列表好产品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total脱色呈现、氧化钙含量巯基,欢迎大家咨询!
借鉴期刊论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663